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課程名稱 |
分子親緣關係學
Molecular Phylogenetics |
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開課學期 |
105-1 |
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授課對象 |
理學院 海洋生物及漁業組 |
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授課教師 |
陳韋仁 |
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課號 |
Ocean5059 |
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課程識別碼 |
241 U1990 |
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班次 |
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學分 |
3 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期四2,3,4(9:10~12:10) |
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上課地點 |
海研232 |
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備註 |
本課程中文授課,使用英文教科書。授課語言視學生需求而定。
總人數上限：15人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1051Ocean5059_ |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
自從DNA結構在1953被發現後, 分子生物技術開始蓬勃發展並開啓了生命科學研究的新紀元, 這包括了紀錄著“生命密碼”的各個物種之基因（體) 的被剖析. 然而, 確立基因彼此間的親緣關係, 乃是關鍵的第一步. 本課程將以此為主軸, 引導學生了解此學門對理解生物多樣性和演化生物學研究的重要性與意義。 |
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課程目標 |
學生藉由授課, 實作(包含資料之收集, 編集與分析), 課堂討論和成果報告
1. 獲得此學門的基本知識與相關應用
2. 學習如何建立分子親緣關係樹
3. 獲得設計與執行相關研究計畫的能力 |
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課程要求 |
修課學生必須有遺傳學的基礎; 最好能自備 Mac (Apple) 電腦 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
另約時間 |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
1.Molecular Evolution: A Phylogenetic Approach
by Roderick D.M. Page, Edward C. Holmes
ISBN: 978-0-86542-889-8
http://as.wiley.com/WileyCDA/WileyTitle/productCd-0865428891.html
2.Inferring phylogenies
By Joseph Felsenstein
http://www.sinauer.com/detail.php?id=1775
3. Phylogenetic trees made easy : a how-to manual / Barry G. Hall
By Barry G. Hall
http://www.sinauer.com/hall/3e/
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
期末報告內容 |
30% |
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2. |
期中考筆試成積 |
20% |
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3. |
學生學習態度 |
50% |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
2016/09/15 |
中秋節, 放假 |
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第2週 |
2016/09/22 |
課程簡介及學門概論 |
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第3週 |
2016/09/29 |
親緣關係樹之剖析 |
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第4週 |
2016/10/06 |
從基因看生物多樣性
延伸閱讀：
本校有整批購買Springer 2015年的電子書，放在SpringerLink平台， "Evolutionary Biology: Biodiversification from Genotype to Phenotype"可在下面網址全文下載:
http://link.springer.com/book/10.1007/978-3-319-19932-0 |
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第5週 |
2016/10/13 |
遺傳變異之計量; 分子演化的模式之剖析; 遺傳資料之收集-I |
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第6週 |
2016/10/20 |
實驗課: 助教上課 |
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第7週 |
2016/10/27 |
實驗課 |
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第8週 |
2016/11/03 |
親緣關係樹之推衍：方法學概論-1 |
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第9週 |
2016/11/10 |
親緣關係樹之推衍：方法學概論-2 |
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第10週 |
2016/11/17 |
期中考 |
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第11週 |
2016/11/24 |
分子親緣關係學的應用 (ㄧ): 物種史的推定與系統分類的應用 |
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第12週 |
2016/12/01 |
分子親緣關係學的應用 (二): 其它關於生物學的應用 (專題演講). |
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第13週 |
2016/12/08 |
遺傳資料之收集和分析-II; 分析實作-I |
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第14週 |
2016/12/15 |
分析實作-II |
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第15週 |
2016/12/22 |
專題討論; 作業討論 |
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第16週 |
2016/12/29 |
親緣關係樹之推衍：分析實作-II
BEAST 分析 |
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第17週 |
2017/01/05 |
論文討論及學生成果發表 |
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第18週 |
01/12 |
論文討論及學生成果發表 |
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