課程名稱 |
生物資訊導論 Introduction to Bioinformatics |
開課學期 |
109-2 |
授課對象 |
醫學院 生理學研究所 |
授課教師 |
曾宇鳳 |
課號 |
md&ph5070 |
課程識別碼 |
420 U3010 |
班次 |
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學分 |
1.0 |
全/半年 |
半年 |
必/選修 |
選修 |
上課時間 |
星期三6(13:20~14:10) |
上課地點 |
基醫509 |
備註 |
本課程中文授課,使用英文教科書。醫學校區研究所共同課程。生物資訊導論僅為生物資訊學之第1小時課程主題講解。與詹迺立、蔡孟勳、范怡琴、歐陽彥正合授 總人數上限:60人 |
Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1092md_ph5070_ |
課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
本課程將討論生物資訊學基本原理及實際應用,以使修習同學能充分掌握如何運用電腦的處理能力,有效解決生醫研究上資料分析,生物醫學資料庫應用分析,以及生物分子結構分析與功能預測。本課程生物資訊導論(課號:MD&PH5028,課程識別碼:420 U3010,1學分)僅為生物資訊學(課號:CSIE5036、課程識別碼:922 U0370,3學分)之第一小時課程主題講解部份,並不包含該課程後二小時電腦軟體及資料庫的使用實習。如需參與電腦上機實習,請改修習生物資訊學。 |
課程目標 |
本課程將討論生物資訊學基本原理及實際應用,以使修習同學能充分掌握如何運用電腦的處理能力,有效解決生醫研究上資料分析,生物醫學資料庫應用分析,以及生物分子結構分析與功能預測。本課程生物資訊導論(課號:MD&PH5028,課程識別碼:420 U3010,1學分)僅為生物資訊學(課號:CSIE5036、課程識別碼:922 U0370,3學分)之第一小時課程主題講解部份,並不包含該課程後二小時電腦軟體及資料庫的使用實習。如需參與電腦上機實習,請改修習生物資訊學。 |
課程要求 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
另約時間 |
指定閱讀 |
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參考書目 |
1. Introduction to Bioinformatics," Arthur M. Lesk, Oxford, 2002
2. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis," David W. Mount, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Lab. Press
3. Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, Andreas D. Baxevanis, B. F. Francis Ouellette, Wuket Kussm, 3rd Edition |
評量方式 (僅供參考) |
No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
1. |
Midterm 1 |
30% |
考試時間一小時 (星期三13:20~14:10) 考試地點: 台大資訊工程系(德田館) 一樓 R103 教室 |
2. |
Midterm 2 |
30% |
考試時間一小時 (星期三13:20~14:10) 考試地點: 台大資訊工程系(德田館) 一樓 R103 教室 |
3. |
Report |
30% |
題目 TBD (在 Midterm 2 後一週公布) |
4. |
Participation |
10% |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
第1週 |
2/24 |
Introduction to bioinformatics (Prof.曾宇鳳) |
第2週 |
3/03 |
Sequence analysis 1 (Prof.范怡琴) |
第3週 |
3/10 |
Sequence analysis 2 (Prof.范怡琴) |
第4週 |
3/17 |
Gene expression 1 (Prof.蔡孟勳) |
第5週 |
3/24 |
Gene expression 2 (Prof.蔡孟勳) |
第6週 |
3/31 |
Midterm 1 (30%) 考試時間一小時 (星期三13:20~14:10) 考試地點 TBD |
第7週 |
4/07 |
Genome analysis (SNP) (Prof.蔡孟勳) |
第8週 |
4/14 |
Genome analysis (Prof.蔡孟勳) |
第9週 |
4/21 |
Data mining 1 (Prof.歐陽彥正) |
第10週 |
4/28 |
Data mining 2 (Prof.歐陽彥正) |
第11週 |
5/05 |
Structural bioinformatics (Prof.曾宇鳳) |
第12週 |
5/12 |
Structural bioinformatics (Prof.詹迺立) |
第13週 |
5/19 |
Midterm 2 (30%) 考試時間一小時 (星期三13:20~14:10) 考試地點 TBD |
第14週 |
5/26 |
Bioinformatics database (Prof.曾宇鳳) |
第15週 |
6/02 |
Phylogenetics analysis (Prof.曾宇鳳) |
第16週 |
6/09 |
Report (30%) |