課程資訊
課程名稱
給生物學家的Python
Python for Biologist 
開課學期
111-1 
授課對象
醫學院  臨床醫學研究所  
授課教師
王弘毅 
課號
ClinMD5014 
課程識別碼
421 U7100 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期五7,8(14:20~16:20) 
上課地點
基醫509 
備註
讓學生能夠學得如何用程式解決生物學與醫學方面的問題。授權碼洽王弘毅老師.與巫孟叡合授
限醫學院學生(含輔系、雙修生) 或 限生命科學院學生(含輔系、雙修生)
總人數上限:24人 
 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

Python在科學的各個領域裡都被廣泛的運用,其處理字串的強大能力更使得Python在生物的各領域如基因組、轉錄組、蛋白組等也被大量的使用。此外Python語法簡潔直觀,又因為大量被使用所以有許多支援的工具,因此很適合程式語法者學習。
本課程將從基本的程式環境與語法開始,漸次指導學生如何利用串列、迴圈、條件運算式處理大量的資料。 

課程目標
讓學生能夠學得如何用程式解決生物學方面的問題 
課程要求
對程式語言有興趣的生科院學生 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
參考書目
Python for Biologist by Dr. Martin Jones 
指定閱讀
無 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/09  中秋節放假 
第2週
9/16  Python 初探 
第3週
9/23  命令列 
第4週
9/30  基本資料型別、字串輸出及處理 I 
第5週
10/07  基本資料型別、字串輸出及處理 II 
第6週
10/14  條件運算式 
第7週
10/21  自訂函式 
第8週
10/28  串列及迴圈 I 
第9週
11/04  串列及迴圈 II 
第10週
11/11  串列及迴圈 III 
第11週
11/18  字典及元組 I(含讀檔) 
第12週
11/25  字典及元組 II(含寫檔)(王老師來跟大家討論個別題目) 
第13週
12/02  巢狀資料結構、模組、例外處理(台大運動會不放假) 
第14週
12/09  程式 walk through 與進階 parsing 技巧 --> Pandas 
第15週
12/16  Numpy 與 Pandas --> Matplotlib 與 Seaborn 
第16週
12/23  Matplotlib 與 Seaborn 製圖 --> 期末專案報告 
第17週
12/30  If we get here, choose your own story (1. Pytest & Git or 2. Class) 
第18週
1/06  期末專案報告