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課程名稱 |
給生物學家的Python
Python for Biologist |
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開課學期 |
111-1 |
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授課對象 |
醫學院 臨床醫學研究所 |
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授課教師 |
王弘毅 |
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課號 |
ClinMD5014 |
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課程識別碼 |
421 U7100 |
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班次 |
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學分 |
2.0 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期五7,8(14:20~16:20) |
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上課地點 |
基醫509 |
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備註 |
讓學生能夠學得如何用程式解決生物學與醫學方面的問題。授權碼洽王弘毅老師.與巫孟叡合授
限醫學院學生(含輔系、雙修生) 或 限生命科學院學生(含輔系、雙修生)
總人數上限：24人 |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
Python在科學的各個領域裡都被廣泛的運用，其處理字串的強大能力更使得Python在生物的各領域如基因組、轉錄組、蛋白組等也被大量的使用。此外Python語法簡潔直觀，又因為大量被使用所以有許多支援的工具，因此很適合程式語法者學習。
本課程將從基本的程式環境與語法開始，漸次指導學生如何利用串列、迴圈、條件運算式處理大量的資料。 |
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課程目標 |
讓學生能夠學得如何用程式解決生物學方面的問題 |
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課程要求 |
對程式語言有興趣的生科院學生 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
無 |
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參考書目 |
Python for Biologist by Dr. Martin Jones |
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評量方式
(僅供參考) |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
9/09 |
中秋節放假 |
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第2週 |
9/16 |
Python 初探 |
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第3週 |
9/23 |
命令列 |
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第4週 |
9/30 |
基本資料型別、字串輸出及處理 I |
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第5週 |
10/07 |
基本資料型別、字串輸出及處理 II |
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第6週 |
10/14 |
條件運算式 |
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第7週 |
10/21 |
自訂函式 |
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第8週 |
10/28 |
串列及迴圈 I |
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第9週 |
11/04 |
串列及迴圈 II |
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第10週 |
11/11 |
串列及迴圈 III |
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第11週 |
11/18 |
字典及元組 I（含讀檔） |
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第12週 |
11/25 |
字典及元組 II（含寫檔）(王老師來跟大家討論個別題目） |
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第13週 |
12/02 |
巢狀資料結構、模組、例外處理（台大運動會不放假） |
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第14週 |
12/09 |
程式 walk through 與進階 parsing 技巧 --> Pandas |
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第15週 |
12/16 |
Numpy 與 Pandas --> Matplotlib 與 Seaborn |
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第16週 |
12/23 |
Matplotlib 與 Seaborn 製圖 --> 期末專案報告 |
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第17週 |
12/30 |
If we get here, choose your own story (1. Pytest & Git or 2. Class) |
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第18週 |
1/06 |
期末專案報告 |
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