課程名稱 |
給生物學家的Python Python for Biologist |
開課學期 |
111-1 |
授課對象 |
醫學院 臨床醫學研究所 臨床試驗組 |
授課教師 |
王弘毅 |
課號 |
ClinMD5014 |
課程識別碼 |
421 U7100 |
班次 |
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學分 |
2.0 |
全/半年 |
半年 |
必/選修 |
選修 |
上課時間 |
星期五7,8(14:20~16:20) |
上課地點 |
基醫509 |
備註 |
讓學生能夠學得如何用程式解決生物學與醫學方面的問題。授權碼洽王弘毅老師.與巫孟叡合授 限醫學院學生(含輔系、雙修生) 或 限生命科學院學生(含輔系、雙修生) 總人數上限:24人 |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
Python在科學的各個領域裡都被廣泛的運用,其處理字串的強大能力更使得Python在生物的各領域如基因組、轉錄組、蛋白組等也被大量的使用。此外Python語法簡潔直觀,又因為大量被使用所以有許多支援的工具,因此很適合程式語法者學習。
本課程將從基本的程式環境與語法開始,漸次指導學生如何利用串列、迴圈、條件運算式處理大量的資料。 |
課程目標 |
讓學生能夠學得如何用程式解決生物學方面的問題 |
課程要求 |
對程式語言有興趣的生科院學生 |
預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
無 |
參考書目 |
Python for Biologist by Dr. Martin Jones |
評量方式 (僅供參考) |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
第1週 |
9/09 |
中秋節放假 |
第2週 |
9/16 |
Python 初探 |
第3週 |
9/23 |
命令列 |
第4週 |
9/30 |
基本資料型別、字串輸出及處理 I |
第5週 |
10/07 |
基本資料型別、字串輸出及處理 II |
第6週 |
10/14 |
條件運算式 |
第7週 |
10/21 |
自訂函式 |
第8週 |
10/28 |
串列及迴圈 I |
第9週 |
11/04 |
串列及迴圈 II |
第10週 |
11/11 |
串列及迴圈 III |
第11週 |
11/18 |
字典及元組 I(含讀檔) |
第12週 |
11/25 |
字典及元組 II(含寫檔)(王老師來跟大家討論個別題目) |
第13週 |
12/02 |
巢狀資料結構、模組、例外處理(台大運動會不放假) |
第14週 |
12/09 |
程式 walk through 與進階 parsing 技巧 --> Pandas |
第15週 |
12/16 |
Numpy 與 Pandas --> Matplotlib 與 Seaborn |
第16週 |
12/23 |
Matplotlib 與 Seaborn 製圖 --> 期末專案報告 |
第17週 |
12/30 |
If we get here, choose your own story (1. Pytest & Git or 2. Class) |
第18週 |
1/06 |
期末專案報告 |
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