每位受訓的學員在訓練的第一年，都會被指派由不同主治醫師指導之病人，; 而這些自己負責的病人療程大多會在訓練的第三年結束之前完成。學員可從中學習各種固定式、活動式或功能性矯正裝置的臨床治療。學員將學習到許多重要的技能，包含矯正診斷、訂定治療計畫、適當的治療目標及各式各樣力學原理與設計、治療後期的微調技術和日後的維持。同時根據各個不同的案例，於病史紀錄、臨床檢查、印模技巧、咬蠟記錄、模型評估、測顱評估、牙弓分析、矯正診斷、治療計畫和各種裝置設計，都能有各別適宜的指導。
在臨床訓練訓練期間，學員將學會如何：
a. 協調訂定並紀錄跨科間的療程計畫。
b. 處置生長中齒顎顏面部的發育障礙患者，藉由適當時機的介入將日後問題減至最低。
c. 適時利用齒顎顏面整形裝置治療患者。
d. 與口腔外科協同治療處理齒顎顏面部的發育障礙。
e. 處置有功能性咬合問題或是顳顎關節障礙的病人。
f. 治療輕微或嚴重牙周問題的病人在齒列矯正方面的問題。
g. 取得並維護一系列長期病人長期的高品質影像檔案如彩色相片、x光片與測顱分析描繪圖。
h. 發展並維護一套長期的治療紀錄，以作為瞭解並訂定治療計劃與日後維持的基礎。
i. 有效處理並鼓勵患者，使其能完全的配合整個矯正療程。
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