課程資訊
課程名稱
 基因體研究論著選讀
GENOMIC STUDY SEMINAR 
開課學期
 96-2 
授課對象
 醫學院  生理學研究所  
授課教師
 賴亮全 
課號
 Physio7017 
課程識別碼
 441 M3400 
班次
  
學分
 2 
全/半年
 半年 
必/選修
 選修 
上課時間
 星期四5,6(12:20~14:10) 
上課地點
  
備註
 上課地點為基楚醫學大樓10樓1003室本課程中文授課,使用英文教科書。?
總人數上限：25人
外系人數限制：10人 
Ceiba 課程網頁
 http://ceiba.ntu.edu.tw/962M3400 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
 核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程內容以最近5年基因體技術相關的期刊論文為主。課程會依據以下部分，找尋適當的期刊論文研讀與討論
1. Human Genome Project
2. Descriptions of various biochips including current and potential applications
3. Microarray for gene expression profiling and applications
4. aCGH (array based Comparative Genomic Hybridization)
5. SNP (single nucleotide polymorphism )
6. microRNA
7. Gene re-sequencing
8. Protein microarray
9. Tissue microarrays
10. Glycomics microarrays
11. DNA Methylation microarrays
12. Functional cell microarrays
13. Chip-on Chip
14. Two hybrid
15. Other array based application
 

課程目標
 本課程主旨在透過期刊論文的研讀以及討論，使同學瞭解基因體技術在生物學上的應用及最新發展趨勢。 
課程要求
  
預期每週課後學習時數
  
Office Hours
 另約時間 
指定閱讀
  
參考書目
  
評量方式
(僅供參考)
  
No.
項目
百分比
說明
1. 
 口頭報告 
40% 
 課堂間的報告 
2. 
 期末報告 
40% 
 分口頭與書面報告兩部分,比例各佔20% 
3. 
 出席 
20% 
  
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
 2/21  Introduction: brief history of genetics 
第2週
 2/28  No class: national holiday 
第3週
 3/06  Comparative Gene-Expression Analysis I: Sequence-based techniques; PCR-based techniques 
第4週
 3/13  Comparative Gene-Expression Analysis II: Hybridization-based techniques--In-house spotted arrays & Prespotted array (inkjet print)  
第5週
 3/20  Comparative Gene-Expression Analysis III: Hybridization-based techniques -- GeneChip & Maskless array synthesis  
第6週
 3/27  Comparative Gene-Expression Analysis IV: Hybridization-based techniques -- BeadChip 
第7週
 4/03  MicroArray Quality Control (MAQC) Project
 
第8週
 4/10  Experimental design of 2-channels microarrays 
第9週
 4/17  No class 
第10週
 4/24  Microarray data analysis 
第11週
 5/01  Array Comparative Genomic Hybridization 
第12週
 5/08  Single Nucleotide Polymorphism 
第13週
 5/15  Chromatin Immunoprecipitation on chip 
第14週
 5/22  DNA Methylation microarrays 
第15週
 5/29  microRNA arrays 
第16週
 6/05  Next generation sequecing 
第17週
 6/12  Final Project Presentation / Final project due