課程資訊
課程名稱
 基因體研究論著選讀
Genomic Study Seminar 
開課學期
 109-2 
授課對象
 醫學院  生理學研究所  
授課教師
 賴亮全 
課號
 Physio7017 
課程識別碼
 441 M3400 
班次
  
學分
 2.0 
全/半年
 半年 
必/選修
 選修 
上課時間
 星期二7,8(14:20~16:20) 
上課地點
 基醫1003 
備註
 總人數上限：25人
外系人數限制：10人 
  
課程簡介影片
 
核心能力關聯
 核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程內容如下:
*Introduction: brief history of genetics
*Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques
-- In-house spotted arrays
-- Prespotted array (inkjet print)
-- Photolithograph
-- Maskless array synthesis
-- BeadChip
-- MicroArray Quality Control (MAQC) Project

*Comparative Gene-Expression Analysis II: PCR-based techniques
-- RT-PCR

*Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques
-- Next generation sequencing

*Genomic approaches to study:
-- Gene expression profiling
-- Single nucleotide polymorphism (SNP), copy number variation (CNV), loss of heterozygosity (LOH)
-- DNA-protein interaction
-- Epigenomic: DNA Methylation
-- Epigenomic: noncoding RNA
-- Metagenomics
-- Carcinogenesis and treatment 

課程目標
 本課程主旨在透過期刊論文的研讀以及討論，使同學瞭解基因體技術在生物學上的應用及最新發展趨勢。 
課程要求
 不遲到早退, 積極參與課堂間的報告與討論, 準時繳交作業. 
預期每週課後學習時數
  
Office Hours
 另約時間 
指定閱讀
  
參考書目
 無 
評量方式
(僅供參考)
  
No.
項目
百分比
說明
1. 
 期中考 
20% 
  
2. 
 期末口頭報告 
20% 
  
3. 
 期末書面報告 
20% 
  
4. 
 作業 
30% 
  
5. 
 出席狀況 
10% 
  
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
 2/23  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques (Homework 1) 
第2週
 3/2  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques 
第3週
 3/9  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques (Homework) 
第4週
 3/16  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques (Homework)
Comparative Gene-Expression Analysis II: PCR-based techniques (Homework) 
第5週
 3/23  Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques (Homework) 
第6週
 3/30  Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques (Homework) 
第7週
 4/6  Spring break 
第8週
 4/13  Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques (Homework) 
第9週
 4/20  Genomic approaches to study DNA structure variation (Mid-term Examination) 
第10週
 4/27  Genomic approaches to study chromosomal aberration (Homework) 
第11週
 5/4  Genomic approaches to study epigenetic regulation: DNA/RNA methylation (Homework) 
第12週
 5/11  Genomic approaches to study epigenetic regulation: non-coding RNA (Homework) 
第13週
 5/18  Genomic approaches to study epigenetic regulation: non-coding RNA (Homework) 
第14週
 5/25  Genomic approaches to study DNA-protein / protein-protein interaction 
第15週
 6/1  Genomic approaches to study metagenomics 
第16週
 6/8  Genomic approaches to study metagenomics / Application in Cancer treatment 
第17週
 6/15  Final Project Presentation