課程資訊
課程名稱
生物資訊學導論
INTRODUCTION OF BIOINFORMATICS 
開課學期
98-2 
授課對象
學程  生物統計學程  
授課教師
林恩仲 
課號
AniSci4002 
課程識別碼
606 36800 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期五3,4(10:20~12:10) 
上課地點
加工204室 
備註
動物科學學群必修
總人數上限:30人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/982intro_bioinfo 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

This course is designed to introduce students into the world of Bioinformatics in genomics and functional genomics. 

課程目標
How bioinformatics works for gene and genomic research will be briefly introduced to the undergraduate students who have taken courses of genetics and molecular genetics/biology (or courses equivalent to). Besides the exams of mid-term and final, we will have a final project for each student to practically apply the skills taught in the classes. All the exams and project will be counted in the final score along with the in-class performance of each student. 
課程要求
genetics and molecular genetics/biology (or courses equivalent to) 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
參考書目
1.Baxevanis, A. D. and Ouellette, B. F. F. (ed.) 2005. Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. 3rd Ed. Published by: John Wiley & Son, Inc., Hoboken, NJ, U.S.A.
2.Gibson, G and S. V. Muse. 2009. A Primer of Genome Sciences. 3rd edition. Published by: Sinauer Associates, Sunderland, MA, USA. 
指定閱讀
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
平常成績 
15% 
出席、作業、提問等 
2. 
期末報告 
25% 
report of final project 
3. 
期中考 
25% 
 
4. 
期末考 
35% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/26  History and definition of bioinformatics 
第2週
3/05  Pairwise sequence alignment 
第3週
3/12  Multiple sequence alignment 
第4週
3/19  BLAST against sequence databases 
第5週
3/26  Alignment of protein sequence 
第6週
4/02  Cluster analysis for cDNA sequences 
第7週
4/09  Gene prediction 
第8週
4/16  Quality control of DNA sequencing 
第9週
4/23  Midterm 
第10週
4/30  Introduction to Public Databases (I) 
第11週
5/07  Introduction to Public Databases (II) 
第12週
5/14  Introduction to Public Databases (III) 
第13週
5/21  Introduction to Public Databases (IV) 
第14週
5/28  Pathway, interaction and function 
第15週
6/04  Phylogenetic analysis (I) 
第16週
6/11  Phylogenetic analysis (II) 
第17週
6/18  Discussion and review
(Turn-in of final report) 
第18週
6/25  Final exam