|
課程名稱 |
生物資訊學導論
Introduction to Bioinformatics |
|
開課學期 |
102-1 |
|
授課對象 |
學程 生物統計學程 |
|
授課教師 |
劉力瑜 |
|
課號 |
Agron5050 |
|
課程識別碼 |
621 U6390 |
|
班次 |
|
|
學分 |
3 |
|
全/半年 |
半年 |
|
必/選修 |
必修 |
|
上課時間 |
星期五5,6,7(12:20~15:10) |
|
上課地點 |
|
|
備註 |
教室:農藝316。第4群選擇必修(依入學年度而有不同規定，請參閱「各系所必修課程查詢」網站)。與蔡政安、董致韡合開
總人數上限：16人 |
|
Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1021IntrBioinf |
|
課程簡介影片 |
|
|
核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
|
課程大綱
|
|
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
|
|
課程概述 |
The course will focus on the analysis and comprehension of genomic data using the open source and open development software, such as R and Bioconductor. Topics covered include: (A) Introduction, (B) Microarray data analysis, (C) Sequence analysis, and (4) Network inference. |
|
課程目標 |
Introduce current status of development of bioinformatics technologies through lecturing, paper reading, and project. |
|
課程要求 |
待補 |
|
預期每週課後學習時數 |
|
|
Office Hours |
另約時間 |
|
指定閱讀 |
待補 |
|
參考書目 |
待補 |
|
評量方式
(僅供參考) |
|
No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
|
1. |
assignment 2 (Liu) |
34% |
|
2. |
presentation (Tung) |
33% |
|
3. |
assignment 1 (Tsai) |
33% |
|
|
|
週次 |
日期 |
單元主題 |
|
第1週 |
9/13 |
Introduction (劉力瑜) |
|
第2週 |
9/20 |
中秋節放假 |
|
第3週 |
9/27 |
Genetics and genomics (董致韡) |
|
第4週 |
10/04 |
Basic statistical concepts (蔡政安) |
|
第5週 |
10/11 |
microarray introduction and preprocessing (蔡政安) |
|
第6週 |
10/18 |
Identifying gene signatures (蔡政安) |
|
第7週 |
10/25 |
class discovery (蔡政安) |
|
第8週 |
11/01 |
class prediction (蔡政安) |
|
第9週 |
11/08 |
Network and systems biology (劉力瑜) |
|
第10週 |
11/15 |
校慶停課一天 |
|
第11週 |
11/22 |
DNA sequencing techniques and genome annotation (董致韡) |
|
第12週 |
11/29 |
Comparative genomics (董致韡) |
|
第13週 |
12/06 |
OMICS (董致韡) |
|
第14週 |
12/13 |
Students' presentation (董致韡) |
|
第15週 |
12/20 |
Sequence alignment (劉力瑜) |
|
第16週 |
12/27 |
Sequencing alignment practice (劉力瑜) |
|
第17週 |
1/03 |
DNA polymorphisms and phylogenetics (劉力瑜) |
|