課程資訊
課程名稱
生物資訊學導論
Introduction to Bioinformatics 
開課學期
100-1 
授課對象
生物資源暨農學院  生物統計學組  
授課教師
劉力瑜 
課號
Agron5050 
課程識別碼
621 U6390 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三7,8(14:20~16:20)星期四2(9:10~10:00) 
上課地點
農藝108 
備註
星期四第2節在農業自動化中心與蕭金福、蔡政安合開
總人數上限:48人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1001Bioinfo 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

The course will focus on the analysis and comprehension of genomic data using the open source and open development software, such as R and Bioconductor. Topics covered include: (A) Introduction, (B) Microarray data analysis, (C) Sequence analysis, and (4) Network inference. The students will be asked to make a term project and to give a final presentation. 

課程目標
Introduce current status of development of bioinformatics technologies through lecturing and paper readings. 
課程要求
Homework 30%; Midterm (proposal) 30%; Final presentation 40%. 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
final presentation 
40% 
 
2. 
proposal 
30% 
 
3. 
homework 
30% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/14; 9/15  Introduction 
第2週
9/21; 9/22  Genetics 101 
第3週
9/28; 9/29  Basic statistical concepts 
第4週
10/5; 10/6  Hypothesis testing 
第5週
10/12; 10/13  microarray introduction and preprocessing 
第6週
10/19; 10/20  Identifying gene signatures 
第7週
10/26; 10/27  class discovery 
第8週
11/2; 11/3  class prediction 
第9週
11/9; 11/10  Open source and open development software 
第10週
11/16; 11/17  <b> Proposal for final presentation</b> 
第11週
11/23; 11/24  DNA sequences techniques 
第12週
11/30; 12/1  Next Generation Sequencing 
第13週
12/7; 12/8  DNA alignment and applications 
第14週
12/14; 12/15  Phylogeny 
第15週
12/21; 12/22  Molecular network 
第16週
12/28; 12/29  Special Topic in Systems Biology 
第17週
1/4; 1/5  Review of final presentation