課程資訊
課程名稱
分子辨識
Molecular Recognition 
開課學期
107-1 
授課對象
生物資源暨農學院  農業化學系  
授課教師
徐駿森 
課號
AC5066 
課程識別碼
623 U4340 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三8,9(15:30~17:20) 
上課地點
農化一第五 
備註
總人數上限:20人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1071AC5066_MR 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

分子辨識課程是應用結構生物、化學生物與分子生物學來探討生命科學的一門課。無論在動物、植物或是微生物的系統,生命現象從微觀的角度來看就是細胞內生物分子經由交互作用而造成訊息傳遞與命令執行之功能。此外,醫學或農業上的病毒或病菌感染、也是藉由特定分子的辨識為起始,進而入侵宿主。瞭解這些生物分子之分子辨識作用,除了能說明其作用機制,並在應用上可發展策略用於抑制或促進其辨識作用及生物活性。  

課程目標
此課程以深入淺出的方式,一開始說明分子辨識的化學原理,接著介紹各項研究分子交互作用之結構與生物物理工具。並以數個具有啟發性的生物交互作用系統為範例。最後由文獻討論來讓參與課程者能將分子結構觀念帶入本身正在研究或有興趣的領域。  
課程要求
歡迎大三以上與研究所不同背景學生,但若未修過生物化學,請先與老師溝通。 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
每週三 13:00~15:00 
參考書目
Arthur M. Lesk, (2004). Introduction of Protein Science. Oxford University Press.
Gordon C.K. Roberts, (2000). NMR of Macromolecules-A practical approach, Oxford University Press.
Gale Rhodes, (2000). Crystallography Made Crystal Clear, Academic Press
 
指定閱讀
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期中考 
20% 
 
2. 
期末考 
30% 
 
3. 
作業 
20% 
 
4. 
報告 
30% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
09/12  Introduction 
第2週
09/19  Structural and Chemical Properties of Biological Macromolecules 
第3週
09/26  Protein Crystallography 
第4週
10/03  Electron Microscopy 
第5週
10/10  國慶日放假 
第6週
10/17  Principle of Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy:
(I)Biomolecular NMR technique 
第7週
10/24  Principle of Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy:
(II)Multi-dimesional NMR for protein determination 
第8週
10/31  兩岸磁共振會議 
第9週
11/07  Mid-term 
第10週
11/14  Biophysical Methods to Probe Non-covalent Molecular Interaction (I):Circular Dichroism, UV and Fluorescence Spectroscopy  
第11週
11/21  Biophysical Methods to Probe Non-covalent Molecular Interaction (II):Surface Plasmon Resonance, ITC and Analytical Ultracentrifugation 
第12週
11/28  Structural Basis of Signal Transduction and Post-translation Modification 
第13週
12/05  Molecular Enzymology 
第14週
12/12  Protein/peptide interaction with membrane 
第15週
12/19  Structural Features of Receptors and ligands 
第16週
12/26  Structural View of Protein-DNA Recognition in Gene Regulation 
第17週
01/02  Molecular Docking and Bioinformatics Approach:Strategies for Drug Discovery, Rational Drug Design versus Drug screen 
第18週
0109  final-exam
1. The PD-1/PD-L1 complex resembles the antigen-binding Fv domains of antibodies and T cell receptors (2008, PNAS 105 (8) 3011-3016)戚本叡
2. Structural basis for cancer immunotherapy by the first-in-class checkpoint inhibitor ipilimumab (2017, PNAS 114 (21) E4223-E4232)黃博洋
3. Crystal Structure of the Human Cannabinoid Receptor CB1 (2016, Cell 16(3):750-762) 洪恩生
4. Crystal structure of the human angiotensin II type 2 receptor bound to an angiotensin II analog (2018, Nature Structural & Molecular Biology 25, pages570–576) 彭立成
5. Crystal structure of lipid A disaccharide synthase LpxB from Escherichia coli (2018, Nature Communication 9(1):377) 楊之綺
6. Crystal structure of a membrane-bound O-acyltransferase (2018, Nature). 吳克峯
7. Structure-Function Analyses of a Caffeic Acid O-Methyltransferase from Perennial Ryegrass Reveal the Molecular Basis for Substrate Preference (2010, Plant Cell 22(12):4114-27) 陳品毓
8. The structural organization of substrate loading in iterative polyketide synthases. (2018, Nature Chemical Biology 14(5):474-479) 詹芷瑄
9. Structure of the core of the type III secretion system export apparatus (2018, Nature Structural & Molecular Biologyvolume 25, pages583–590) 朱祐萱
10. Structure and mechanism of the M2 proton channel of influenza A virus. (2008, Nature 451(7178):591-5) 宋育徵
11. Characterization and engineering of a plastic-degrading aromatic polyesterase (2018, PNAS 115(19):E4350-E4357) 張凌誌
12. Molecular Mechanism of Action of Microtubule-Stabilizing Anticancer Agents (2013, Science 339: 587-590) 許甯翔
13. Crystal Structure of Cas9 in Complex with Guide RNA and Target DNA (2014, Cell 156(5):935-949) 薛仲凱
14. Structural Basis for Double-Stranded RNA Processing by Dicer (2006, Science 311: 195-198) 邱乙雯