課程資訊
課程名稱
微生物學特論
Special Topics in Microbiology 
開課學期
108-2 
授課對象
生物資源暨農學院  農業化學研究所  
授課教師
林乃君 
課號
AC5085 
課程識別碼
623 U4510 
班次
 
學分
1.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
第1,2,3,4 週
星期一A,B(18:25~20:10)星期三A,B(18:25~20:10)星期五A,B(18:25~20:10) 
上課地點
農化二106農化二106農化二106 
備註
本課程以英語授課。密集課程。第1週必到,UniversityofWestFlorida鍾慧敏老師合授
總人數上限:30人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1082AC5085_bioinfo 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

大家好,在這個為期三個星期的研究課程裡,我們希望和同學一起從生物信息學(Bioinformatics) 的觀點解碼微生物如何用簡單的核酸序列編寫它們的基因,決定所需蛋白質的結構等,進而認識微生物世界的奧妙。 

課程目標
o熟悉基本生物信息學操作
o解碼噬菌體基因體
o研讀生物信息學文獻 
課程要求
Taught in English; a guest instructor, Dr. Hui-Min Chung from
Department of Biology, University of West Florida
email: hchung@uwf.edu
與西佛羅里達大學鍾慧敏博士合授。第一堂 3/2 (一)第 A 節必到。
修過普通微生物學 (或類似課程)
3/2~3/20 每周一、三、五 18:25~20:10 農化新館 106 教室 (請自備筆記型電腦) 
Office Hours
另約時間 
參考書目
Kieser, T., Bibb, M. J., Buttner, M. J., Chater, K. F., and Hopwood, D. A. 2000. Practical Streptomyces genetics. John Innes Foundation, Norwich, England. 
指定閱讀
於授課期間公布於網站 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
pre-lab quiz 
20% 
open book 
2. 
paper discussion 
20% 
References will be provided in advance and discuss in class 
3. 
progress report 
20% 
during the class 
4. 
final presentation 
20% 
At the end of the class 
5. 
attendance/participation 
20% 
Students are encouraged to discuss and interact with instructors and classmates. Absence in anyone of this course will lead to failure of this class 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
03/02  Introduction and bacteriophage biology 
第2週
03/04  Genome annotation overview 
第3週
03/06  Preparation for annotation 
第4週
03/09  Automatically annotating your genome (I) 
第5週
03/11  Automatically annotating your genome (II) 
第6週
03/13  Refining your annotation (I) 
第7週
03/16  Refining your annotation (II) 
第8週
03/18  Finalizing your annotation 
第9週
03/20  Final presentation