課程資訊
課程名稱
厭氧暨極端微生物原理與應用
Theory and Application of anaerobes and extremophiles 
開課學期
110-2 
授課對象
生物資源暨農學院  農業化學研究所  
授課教師
江殷儒 
課號
AC5095 
課程識別碼
623 U5020 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期五6,7(13:20~15:10) 
上課地點
農化二106 
備註
需修習過普通微生物學或微生物生理學
總人數上限:40人
外系人數限制:5人 
 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

待補極端微生物(extremophile),係指偏好在極端環境中生長繁殖的微生物,通常爲單細胞原核或真核生物。極端環境係指不適合脊椎動物生活之環境,包括缺乏氧氣、極端溫度、極端酸鹼值或是高鹽度等理化條件。伴隨新興微生物分析技術之興起,極端微生物之親緣及代謝多樣性研究,近來獲得許多重大進展。相關之微生物乃至酵素或代謝物,具有相當之生技、農業與工業應用潛力。本課程首先將簡介極端微生物的多樣性與相關分離培養技術。隨後系統性地說明各種重要之極端微生物的生理特性與代謝行為。最後介紹厭氧及極端微生物及其產生之代謝物與酵素的生技、農業與工業應用案例。在本課程之最後,將鼓勵學生依據個別興趣,研讀新進之相關論文,進行口頭書報討論,並書寫成書面報告。 

課程目標
台灣地理地形歧異度大,擁有各式酸鹼性溫泉、海底熱泉、鹽埕乃至受到重金屬汙染之環境,棲息有許多未知之極端微生物,值得進行採集與研究。另外,腸道菌相屬於精準醫療之範疇,需要厭氧知識與技術,方能深入探索。透過系統性地介紹已知的厭氧及極端微生物之生理代謝特性,協助學生建立足夠之背景知識;期能幫助學生探索本土菌種,將之開發成生物資源,貢獻於台灣本土之相關生技產業。 
課程要求
修習過普通微生物學、微生物生理學為佳 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
每週五 15:30~16:00 
指定閱讀
依據自身興趣,選擇適當之主題,研讀近5年關於微生物生理與代謝及生理生態之研究論文(research articles)或文獻回顧(review articles or mini-reviews)。據此整理口頭及書面報告。 
參考書目
Brock Biology of Microorganisms 15th (Michael Madigan, Kelly Bender, Daniel Buckley, W. Sattley, David Stahl; 2018; Pearson Education)
Extremophiles: from Biology to Biotechnology (Ravi Durvasula and D. V. Subba Rao; 2018; CRC Press Taylor & Francis Group)
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
出席率與課程參與程度 
20% 
出席率佔10%(每缺課乙次,扣總分1分);課程參與程度之評量(佔10%)包括提問與回答之次數,課程專注度。 
2. 
口頭報告 
40% 
依據修課學生數,安排每人10~20分鐘的特定主題報告(乙次/學期)。建議準備15張以內之PowerPoint slides。檔案內容及精細程度佔20%;口頭報告內容與問答各佔15%及5%。 
3. 
書面報告 
40% 
學生得依據上課內容,尋找合適之微生物生理及代謝與生理生態相關之主題。配合尋找最新(或近5年)之研究論文或文獻回顧(可找授課老師討論及建議)。詳閱理解後,整理成書面報告。原則上為10頁左右(約為3000~5000中文字;或是2000~3000英文字)之A4格式。報告主題得與口頭報告之主題類似。 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/18  微生物的多樣性與演化 
第2週
2/25  厭氧微生物技術 
第3週
3/4  極端真核微生物的生理與代謝 
第4週
3/11  硝酸還原菌的生理與代謝 
第5週
3/18  鐵還原菌的生理與代謝 
第6週
3/25  硫酸還原菌的生理與代謝 
第7週
4/1  產乙酸菌的生理與代謝 
第8週
4/8  產甲烷菌的生理與代謝 
第9週
4/15  綜合體學應用於腸道菌相分析 
第10週
4/22  極地及沙漠微生物的生理與代謝 
第11週
4/29  熱泉微生物的生理與代謝 
第12週
5/6  鹽湖微生物的生理與代謝 
第13週
5/13  厭氧微生物及酵素的生技應用 
第14週
5/20  極端微生物及酵素的生技應用 
第15週
5/27  書報討論I 
第16週
6/3  書報討論II