課程資訊
課程名稱
進階生物晶片操作與資料分析
Advanced Biochip Technology and Data Analysis 
開課學期
110-2 
授課對象
生命科學院  基因體與系統生物學學位學程  
授課教師
蔡孟勳 
課號
Biot7027 
課程識別碼
642EM0280 
班次
 
學分
3.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期四6,7,8(13:20~16:20) 
上課地點
 
備註
本課程以英語授課。上課地點:R415
限碩士班以上
總人數上限:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1102Biot7027_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

1.基本分子生物實驗的操作,包含細菌培養,DNA分離,電泳分析以及PCR.
2.基因晶片備製過程學習
3.細胞培養及RNA的提取
4.基因晶片的螢光標記和雜交反應
5.基因晶片的螢光掃描以及影像分析
6.建立基因晶片數據資料庫
7.利用高階軟體進行基因晶片結果之分析判讀以及推論實驗結果在生物上的意義 

課程目標
使學生對於基因晶片的備製,應用及結果之分析有實際操作和深切的認識,進而啟發學生在此一新興跨領域的學習與研究。 
課程要求
一、成績評量方式:
1.出席及課堂表現 10%
2.實驗報告 50 %
3.期末考 40%

二、預修課程:
生物晶片技術概論 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
參考書目
教科書: DNA Microarrays :A Molecular Cloning Manual
David Bowtell and Joseph Sambrook
Cold Spring Harbor Laboratory Press 
指定閱讀
待補 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
出席及課堂表現 
10% 
 
2. 
實驗報告 
50% 
 
3. 
期末考 
40% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/17  Introduction 
第2週
2/24  miniprep and run DNA gel electrophoresis 
第3週
3/03  PCR intro, spectrophotometer
intro 
第4週
3/10  Sanger sequencing intro 
第5週
3/17  Sanger sequencing data analysis 
第6週
3/24  Cell culture and RNA extraction 
第7週
3/31  RNA extraction and purification 
第8週
4/07  Mid term 
第9週
4/14  NGS intro and gDNA extraction 
第10週
4/21  Metagenomics library preparation 
第11週
4/28  Class suspension (COVID19) 
第12週
5/05  Metagenomics library preparation 
第13週
5/12  Data analysis (linux intro & metagenomics) 
第14週
5/19  Illumina and Affymetrix biochip intro 
第15週
5/26  Real-time RT PCR 
第16週
6/02  Final exam