課程資訊
課程名稱
生物晶片操作與資料分析
MICROARRAY EXPERIMENT AND DATA ANALYSIS 
開課學期
97-2 
授課對象
生物資源暨農學院  生物科技研究所  
授課教師
蔡孟勳 
課號
Biot5006 
課程識別碼
642EU0080 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期四5,6,7(12:20~15:10) 
上課地點
生技所410 
備註
本課程以英語授課。
限學士班三年級以上
總人數上限:10人
外系人數限制:9人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/972microarraylab 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

Introduction of microarray and data analysis
Generation of Targets for spotted microarray
Sample plate design for spotted microarray
Printing design of microarray chip
Post-processing for microarray chip
Introduction of cell culture and RNA sample extraction
RNA purification and RNA quality check
Microarray hybridization
Microarray image scanning
Gal file preparation
Introduction of databases for microarray data analysis
 

課程目標
This course will introduce basic concepts and techniques of “Microarray experiment and data analysis”. This course also provides the hand-on experiments for students to learn how to make microarray chips, microarray hybridization and microarray data analysis. Students will learn the hand-on skills of microarray related technology and gain a great vision on current trends of investigations in this field to lead their own research. 
課程要求
 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
出席及課堂表現 
10% 
 
2. 
實驗報告 
50% 
 
3. 
期末考 
40% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/19  Overview 
第2週
2/26  mini prep 
第3週
3/5  PCR 
第4週
3/12  Automation liquid handing platform 
第5週
3/19  Printing design (OmniGrid arrayer) 
第6週
3/26  Post-processing 
第8週
4/9  Cell culture and RNA extraction 
第9週
4/16  Midterm  
第11週
4/30  RNA purification and quality check 
第12週
5/07  cDNA labeling & hybridization 
第13週
5/14  BioinformaticsGal file preparation and scan image (Axon scanner intro) 
第14週
5/21  BioinformaticsWeb-based Microarray Analysis System 
第15週
5/28  Holiday 
第16週
6/04  Real-time RT PCR 
第17週
6/11  Illumina and Affymetrix systems 
第18週
6/18  Final