課程資訊
課程名稱
基因體數量分析方法
Quantitative Method of Genomic Research 
開課學期
103-2 
授課對象
學程  分子醫學學分學程  
授課教師
程蘊菁 
課號
EPM7174 
課程識別碼
849 M0690 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期一7,8(14:20~16:20) 
上課地點
公衛210 
備註
本課程中文授課,使用英文教科書。與盧子彬合開
限學士班三年級以上
總人數上限:20人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1032EPM7174_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主旨在於學習如何分析基因體及遺傳相關的資料,目的在於循序漸進以進行基因體及遺傳相關研究。課程內容分為二大部份:基因體及遺傳關聯分析以及其於不同領域之應用。針對每一部分,先介紹實驗設計,接下來運用各種遺傳軟體進行實際分析。修課學生以具備遺傳學、生物統計或生物資訊的背景,或相關研究的經驗為佳。學生將需繳交作業與期中、期末報告。
 

課程目標
訊練學生做基因相關研究的實務分析能力 
課程要求
英文文獻的閱讀及遺傳分析軟體之操作 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
1) Human Genome Epidemiology
Khoury MJ, Little J, Burke W (Eds.) 2004
2) Introduction to Genetic Analysis
Griffiths AJF, Wessler SR, Lewontin RC, Carroll SB (Eds.) 9th ed., 2008
 
參考書目
1) Statistical Methods in Genetic Epidemiology, Duncan C. Thomas Oxford 2004.



 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
作業  
30% 
每份作業10% 
2. 
期中及期末報告 
50% 
期中:25%; 期末:25% 
3. 
課堂參與 
20% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
02/23  年假
Holiday
 
第2週
03/02  序論及遺傳關聯性研究設計
Introduction & Study Design of Genetic Association Study  
第3週
03/09  遺傳標記的選取 (作業1)
Selection of Genetic Markers (HW1) 
第4週
03/16  遺傳半型block與連鎖不平衡
Haplotype Block and Linkage Disequilibrium 
第5週
03/23  哈溫平衡測定及單一核苷酸多型性分析
Hardy-Weinberg Equilibrium Test & SNP analyses  
第6週
03/30  遺傳半型分析 (作業2)
Haplotype Analyses (HW2)
 
第7週
04/06  清明假期
Holiday
 
第8週
04/13  多重測定之校正 (胡賦強老師)
Special talk: Correction for Multiple Tests 
第9週
04/20  全基因關聯研究
Genome-Wide Association Study
 
第10週
04/27  失智症及攝護腺癌遺傳流行病學
Genetic Epidemiologic Study on Dementia and Prostate Cancer
 
第11週
05/04  期中討論及報告I
Midterm Discussion and Presentation I
 
第12週
05/11  期中討論及報告II
Midterm Discussion and Presentation II
 
第13週
05/18  探討潛在生物路徑
Explore potential Biological Pathways
 
第14週
05/25  表基因體學簡介及觀念
Epigenetics: Introduction and general concepts
 
第15週
06/01  非轉錄RNA之簡介及觀念
Introduction and general concepts of Non-Coding RNA
 
第16週
06/08  微陣列晶片之介紹與應用(作業3)
Introduction and applications of microarray(HW3)

 
第17週
06/15  次世代定序技術簡介與範例
Introduction and examples of next-generation sequencing
 
第18週
06/22  期末報告
Final Presentation