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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
02/20 |
計算生物學介紹 Introduction of computational biology |
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第2週 |
02/27 |
生物核心能力 (I) – 基礎遺傳學、演化機制 Concept of biology (I) – genetics and evolution |
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第3週 |
03/06 |
停課 |
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第4週 |
03/13 |
生物核心能力 (II) – 基礎分子生物學與基因調控機制Concept of biology (II) – molecular biology and gene regulation mechanism |
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第5週 |
03/20 |
程式核心能力 (II) – 程式邏輯控制、迴圈撰寫 Concept of programming in R (II) – Programming logic |
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第6週 |
03/27 |
程式核心能力 (III) –程式邏輯控制、隨機取樣、繪圖 Concept of programming in R (III) – Programming logic, random sampling and creating plots |
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第7週 |
04/03 |
溫書假 (holiday) |
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第8週 |
04/10 |
基因演算法 Genetic Algorithm |
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第9週 |
04/17 |
高通量資料分析介紹 – 以基因表現微陣列為例High-throughput data (Gene Expression Microarray) |
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第10週 |
04/24 |
期中報告 Midterm presentation |
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第11週 |
05/01 |
演算法分析介紹 – 以排序方法為例介紹時間與空間複雜性 Algorithm comparison – introduction of time and space complexity |
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第12週 |
05/08 |
演化分析 – 演化樹與最大節約法 Methods in evolution – phylogenetic tree and maximum parsimony |
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第13週 |
05/15 |
序列排比分析 Sequence analysis |
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第14週 |
05/22 |
交互驗證與排列 – 資料重複性與預測性Cross-validation and Permutation – reproducibility and predictability |
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第15週 |
05/29 |
機器學習方法 (向量支持模型與決策樹) Machine learning methods (SVM, CART) |
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第16週 |
06/05 |
專題演講 (Special lecture) |
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第17週 |
06/12 |
高通量資料分析介紹 – 以次世代定序技術為例 High-throughput data (Next Generation Sequencing) |
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第18週 |
06/19 |
期末報告 Final presentation |
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第5-0週 |
03/20 |
程式核心能力 (I) – 資料輸出與輸入、統計檢定與迴歸模型 Concept of programming in R (I) – data processing, statistical tests and regression models |