課程資訊
課程名稱
傳染病分子流行病學
Molecular Epidemiology in Infectious Diseases 
開課學期
107-2 
授課對象
學程  傳染病學學程  
授課教師
范怡琴 
課號
EPM5024 
課程識別碼
849 U0520 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期一6,7(13:20~15:10) 
上課地點
公衛209 
備註
與蔡坤憲、方啟泰、施惟量合授
總人數上限:24人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1072EPM5024_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

分子流行病學研究涵蓋分子生物學和流行病學領域。本課程著重原理、應用和實作了解如何應用分子生物技術進行流行病學研究,採循序漸進方式讓學生先了解基礎微生物學、免疫學、分子生物學,接著以原理和方法應用講解如何利用分子檢測和親緣性分析探討致病原流行趨勢、來源、傳播模式,以及致病原基因特性和流行病學相關。分子檢測內容包含核苷酸和非核苷酸檢測方法;親緣性分析採分階段說明基礎定序原理、序列分析方式、至利用基因序列進行親緣性分析;本課程未包含流行病學研究設計和分析方法,此內容請參考「流行病學原理」課程。 

課程目標
1.培養學生對微生物學、免疫學、分子生物學之興趣和奠立基礎。
2.培養學生具備設計、執行、評估及改善分子檢測方法之能力。
3.培養學生具備解讀親緣性研究之能力。 
課程要求
課前至CEIBA課程網站下載投影片並在課後複習
分子檢測分析實作: 學生需備有實驗衣
親緣性分析實作: 學生需備有筆電
1次期中考: 第一至第七周課程內容
1次實作課程書面報告: 挑選一次實作結果以電子檔繳交報告
1次期末口頭報告新穎分子檢驗技術文獻或親緣性分析文獻 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
參考書目
1. Riley, Lee. W. Molecular Epidemiology of Infectious Diseases: Principles and Practices. Washington, D.C. : ASM Press. (2004)
2. Murray, Patrick R., Rosenthal, Ken S., Pfaller, Michael A. Medical Microbiology; Eighth Edition. Philadelphia, Pennsylvania: Elsevier (2016)
3. Hall, Barry G. Phylogenetic trees made easy: a how-to manual; Fourth Edition. Sunderland, Mass. : Sinauer Associates. (2011)
課堂中引用之重要參考文獻會於課前上傳至CEIBA課程網站上。
Critical references will be uploaded to CEIBA before the lecture. 
指定閱讀
待補 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期中考  
30% 
一至七周課程內容為考題.  
2. 
實作結果報告  
20% 
挑選一次實作結果繳交電子檔報告 
3. 
期末報告 
20% 
特定主題 
4. 
課程參與  
30% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/18  傳染病分子流行病學歷史和應用 (History and application of molecular epidemiology in infectious diseases) 
第2週
2/25  細菌基因複製、轉移、轉譯 (Genetic replication, genetic transfer, and translation in bacteria) 
第3週
3/04  細菌和宿主交互作用 (Bacterium-host interaction) 
第4週
3/11  病毒複製和演化 (Viral replication and evolution) 
第5週
3/18  病毒和宿主交互作用 (Virus-host interaction) 
第6週
3/25  非核苷酸檢測原理和應用: 生化特性檢驗法 (The principle and application of non-nucleotide detection: detection of biochemical characters) 
第7週
4/1  核苷酸檢測原理和應用: 非聚合酶連鎖反應檢測 
第8週
4/08  期中考
9樓生物安全訓練 (9F biosafety training) 
第9週
4/15  非核苷酸檢測原理和應用: 抗體抗原檢驗法和實作 (I) (The principle and application of non-nucleotide detection: detection of antigens and antibodies in lab)  
第10週
4/22  非核苷酸檢測原理和應用: 抗體抗原檢驗法和實作 (II) (The principle and application of non-nucleotide detection: detection of antigens and antibodies in lab) 
第11週
4/29  核苷酸檢測原理和應用: 聚合酶連鎖反應檢測和實作 (I) (The principle and application of nucleotide detection: PCR-based detection in lab) 
第12週
5/06  核苷酸檢測原理和應用: 聚合酶連鎖反應檢測和實作 (II) (The principle and application of nucleotide detection: PCR-based detection in lab) 
第13週
5/13  親緣性分析和實作: 基因序列 (I) (Phylogenetic analysis in lab: genetic sequences) 
第14週
5/20  親緣性分析和實作: 基因序列 (II) (Phylogenetic analysis in lab: genetic sequences) 
第15週
5/27  施惟量老師專題演講 (Special lecture) 
第16週
6/03  蔡坤憲老師專題演講 (Special lecture) 
第17週
6/10  方啟泰老師專題演講 (Special lecture) 
第18週
6/17  期末口頭報告 (Student oral presentation)