|
課程名稱 |
生物資訊學
Bioinformatics |
|
開課學期 |
99-2 |
|
授課對象 |
學程 能源科技學程 |
|
授課教師 |
曾宇鳳 |
|
課號 |
CSIE5036 |
|
課程識別碼 |
922 U0370 |
|
班次 |
|
|
學分 |
3 |
|
全/半年 |
半年 |
|
必/選修 |
選修 |
|
上課時間 |
星期三5,6,7(12:20~15:10) |
|
上課地點 |
|
|
備註 |
生物資訊與系統生物學程必修課，學程學生優先選。上課地點：醫學院電腦教室R509。合開教師：TBA
限學士班三年級以上
總人數上限：50人 |
|
Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/992bioinformatics |
|
課程簡介影片 |
|
|
核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
|
課程大綱
|
|
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
|
|
課程概述 |
To be announced |
|
課程目標 |
To be announced |
|
課程要求 |
|
|
預期每週課後學習時數 |
|
|
Office Hours |
|
|
指定閱讀 |
|
|
參考書目 |
Introduction to Bioinformatics," Arthur M. Lesk, OXFORD, 2002
Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis," David W. Mount, 2nd Edition,
Cold Spring Harbor Lab. Press
Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins,
Andreas D. Baxevanis, B. F. Francis Ouellette, Wuket0Kussm 3rd Edition |
|
評量方式
(僅供參考) |
|
No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
|
1. |
Midterm 1 |
30% |
|
2. |
Midterm 2 |
30% |
|
3. |
Final demo |
30% |
|
4. |
Others |
10% |
|
|
|
週次 |
日期 |
單元主題 |
|
第1週 |
2/23 |
Introduction of bioinformatics |
|
第2週 |
3/2 |
Sequence analysis |
|
第3週 |
3/9 |
Genome analysis |
|
第4週 |
3/16 |
Gene expression 1 |
|
第5週 |
3/23 |
Gene expression 2 |
|
第6週 |
3/30 |
Microarray analysis practice |
|
第7週 |
4/6 |
No class |
|
第8週 |
4/13 |
Midterm I |
|
第9週 |
4/20 |
Genetics and population analysis |
|
第10週 |
4/27 |
Phylogentics analysis |
|
第11週 |
5/4 |
Structural classification of proteins |
|
第12週 |
5/11 |
Structural bioinformatics |
|
第13週 |
5/18 |
Bioinformatics Databases, |
|
第14週 |
5/25 |
Midterm II |
|
第15週 |
6/1 |
Bioinformatics database and ontology |
|
第16週 |
6/8 |
Data mining |
|
第17週 |
6/15 |
Text mining |
|
第18週 |
6/22 |
Final project demo |
|