課程資訊
課程名稱
 專題討論
Seminar 
開課學期
 105-2 
授課對象
 生醫電子與資訊學研究所  
授課教師
 阮雪芬 
課號
 BEBI8001 
課程識別碼
 945 D0040 
班次
 01 
學分
 0.0 
全/半年
 半年 
必/選修
 必修 
上課時間
 星期一6,7(13:20~15:10) 
上課地點
  
備註
 博士班在學期間必修，修滿8學期通過者得免修。上課地點：明達館205教室。上課時間：單數週一67節週一單週上課。
限博士班 且 限學號單號
總人數上限：50人 
Ceiba 課程網頁
 http://ceiba.ntu.edu.tw/1052BEBI8001_01 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
 核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主要報告深入學習(deep learning) 相關的文章, 分組上台報告, 討論, 以訓練學生學習最新的知識, 閱讀文章, 組織和團隊合作及報告能力 

課程目標
 訓練學生學習最新的知識, 閱讀文章, 組織和團隊合作及報告能力 
課程要求
 上課不遲到, 不早退, 努力認真學習, 每次課一結束馬上繳交報告 
預期每週課後學習時數
  
Office Hours
  
參考書目
 research journal papers 
指定閱讀
 papers in deep learning  
評量方式
(僅供參考)
  
No.
項目
百分比
說明
1. 
 平時表現 
50% 
 平時發問, 心得報告及出席狀況 
2. 
 文章報告 
50% 
 口頭報告, 團隊合作貢獻度 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
 2/20  上課 
第2週
 2/27  放假 
第3週
 3/06  中研院廖俊智院長演講 
第4週
 3/13  X 
第5週
 3/20  [第九組] Romo‐Bucheli, David, et al. "A deep learning based strategy for identifying and associating mitotic activity with gene expression derived risk categories in estrogen receptor positive breast cancers." Cytometry Part A (2017).
[第七組] SHAHIN, MOSTAFA, et al. "Deep Learning and Insomnia: Assisting Clinicians with their Diagnosis." IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics (2017). 
第6週
 3/27  X 
第7週
 4/03  放假 
第8週
 4/10  [第八組] Jaderberg, Max, et al. "Reading text in the wild with convolutional neural networks." International Journal of Computer Vision 116.1 (2016): 1-20.
[第一組] Leung, Michael KK, et al. "Deep learning of the tissue-regulated splicing code." Bioinformatics 30.12 (2014): i121-i129. 
第9週
 4/17  期中考 
第10週
 4/24  X 
第11週
 5/01  [第三組] Alipanahi, Babak, et al. "Predicting the sequence specificities of DNA-and RNA-binding proteins by deep learning." Nature biotechnology 33.8 (2015): 831-838.
[第五組] Litjens, Geert, et al. "Deep learning as a tool for increased accuracy and efficiency of histopathological diagnosis." Scientific reports 6 (2016). 
第12週
 5/08  X 
第13週
 5/15  [第十組] Zhou, Jian, and Olga G. Troyanskaya. "Predicting effects of noncoding variants with deep learning-based sequence model." Nature methods 12.10 (2015): 931-934.
[第二組] Aliper, Alexander, et al. "Deep learning applications for predicting pharmacological properties of drugs and drug repurposing using transcriptomic data." Molecular pharmaceutics 13.7 (2016): 2524-2530. 
第14週
 5/22  X 
第15週
 5/29  放假 
第16週
 6/5  校外參訪 
第17週
 6/12  [第六組] Liu, Yi, et al. "Finger vein secure biometric template generation based on deep learning." Soft Computing (2017): 1-9.
[第四組] Zhu, Zhe, et al. "Traffic-sign detection and classification in the wild." Proceedings of the IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition. 2016.