課程資訊
課程名稱
生物資訊學實習
BIOINFORMATIC LAB. 
開課學期
96-2 
授課對象
生命科學院  生命科學系  
授課教師
阮雪芬 
課號
LS3006 
課程識別碼
B01 31060 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期三3,4,@(10:20~) 
上課地點
生科612 
備註
F群選擇必修。需修過正課或與正課同時修習。與林仲彥合開
限學士班三年級以上 且 限本系所學生(含輔系、雙修生)
總人數上限:15人 
 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主在介紹現今在生物資訊
領域的相關知識.課程內容包括:
Introduction, Biological
Databases, Analysis at the
Nucleotide and Protein
Level, Inferring
Relationships等,並進行現場操
作,讓學生熟悉生物資訊學軟體
及其應用。
 

課程目標
希望訓練學生利用生物資訊工具 進行其它課程的資料收集及分析 
課程要求
必修或同時修生物資訊學  
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
參考書目
Bioinformatics: A practical guide to the analysis of genes
and proteins (2005), Andreas D. Baxevanis and B. F.
Francis Ouellette, Wiley-Liss (藝軒)  
指定閱讀
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
平時報告及表現  
50% 
 
2. 
期末報告  
50% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/20  分配電腦及分組 
第2週
2/27  Introduction 
第3週
3/05  Biological Databases I: Sequence Databases 
第4週
3/12  Biological Databases II: Mapping Databases 
第5週
3/19  Biological Databases III: Information Retrieval from Biological Databases 
第6週
3/26  Analysis at the Nucleotide Level I: Predictive Methods Using DNA Sequences 
第7週
4/02  Analysis at the Nucleotide Level II: Predictive Methods Using RNA Sequences 
第8週
4/09  Analysis at the Nucleotide Level III: Sequence Polymorphism 
第9週
4/16  期中考週 
第10週
4/23  Analysis at the Protein Level I: Predictive Methods Using Protein Sequences 
第11週
4/30  Analysis at the Protein Level II: Protein Structure Prediction and Analysis 
第12週
5/07  Analysis at the Protein Level III: Intermolecular Interactions and Biological Pathways 
第13週
5/14  Inferring Relationships I: Assessing Pairwise Sequence Similarity: BLAST and FASTA 
第14週
5/21  Inferring Relationships II: Assessing Pairwise Sequence Similarity: Analysis of Protein Multiple Sequence Alignment 
第15週
5/28  Inferring Relationships III: Phylogenetic Analysis 
第16週
6/04  Inferring Relationships IV: Using DNA Microarrays to Assay Gene Expression 
第17週
6/11  Inferring Relationships V: Proteomics and Protein Identification 
第18週
6/18  期末考週