課程資訊
課程名稱
生物資訊學實習
BIOINFORMATIC LAB. 
開課學期
97-2 
授課對象
生命科學院  生命科學系  
授課教師
阮雪芬 
課號
LS3006 
課程識別碼
B01 31060 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期四3,4,@(10:20~) 
上課地點
計資212 
備註
F群選擇必修。需修過正課或與正課同時修習。與林仲彥合開
限學士班三年級以上 且 限本系所學生(含輔系、雙修生)
總人數上限:15人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/972bil 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主在介紹現今在生物資訊領域的相關知識. 課程內容包括: Introduction, Biological Databases, Analysis at the Nucleotide and Protein Level, Inferring Relationships等
1. Introduction
2. Biological Databases I: Sequence Databases
3. Biological Databases II: Mapping Databases
4. Biological Databases III: Information Retrieval from Biological Databases
5. Analysis at the Nucleotide Level I: Predictive Methods Using DNA Sequences
6. Analysis at the Nucleotide Level II: Predictive Methods Using RNA Sequences
7. Analysis at the Nucleotide Level III: Sequence Polymorphisms
8. Analysis at the Protein Level I: Predictive Methods Using Protein Sequences
9. Analysis at the Protein Level II: Protein Structure Prediction and Analysis
10. Analysis at the Protein Level III: Intermolecular Interactions and Biological Pathways
11. Inferring Relationships I: Assessing Pairwise Sequence Similarity: BLAST and FASTA
12. Inferring Relationships II: Creation and Analysis of Protein Multiple Sequence Alignment
13. Inferring Relationships III: Phylogenetic Analysis
14. Inferring Relationships IV: Using DNA Microarrays to Assay Gene Expression
15. Inferring Relationships V: Proteomics and Protein Identification
16. Drug Discovery and Bioinformatics
 

課程目標
希望訓練學生利用生物資訊工具及知識進行其它課程的資料收集及分析 
課程要求
 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
參考書目
 
指定閱讀
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期中考 
20% 
 
2. 
期末考 
30% 
 
3. 
平時表現 
20% 
三次曠課未到,學期成績不及格。遲到一次扣學期成績一分,依此類推。 
4. 
平時報告 
30% 
平時報告遲交每次扣學期成績1分,未交則扣學期成績2分。 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/19  分配電腦及分組 
第2週
2/26  Biological Databases I: Sequence Databases 
第3週
3/05  Biological Databases II: Mapping Databases 
第4週
3/12  Biological Databases III: Information Retrieval from Biological Databases 
第5週
3/19  Analysis at the Nucleotide Level I: Predictive Methods Using DNA Sequences 
第6週
3/26  Analysis at the Nucleotide Level II: Predictive Methods Using RNA Sequences 
第7週
4/02  溫書假 
第8週
4/09  Analysis at the Nucleotide Level III: Sequence Polymorphism 
第9週
4/16  期中考 
第10週
4/23  Analysis at the Protein Level I: Predictive Methods Using Protein Sequences 
第11週
4/30  Analysis at the Protein Level II: Protein Structure Prediction and Analysis 
第12週
5/07  Analysis at the Protein Level III: Intermolecular Interactions and Biological Pathways 
第13週
5/14  Inferring Relationships I: Assessing Pairwise Sequence Similarity: BLAST and FASTA 
第14週
5/21  Inferring Relationships II: Creation and Analysis of Protein Multiple Sequence Alignment 
第15週
5/28  端午節放假 
第16週
6/04  Inferring Relationships III: Phylogenetic Analysis 
第17週
6/11  Inferring Relationships IV 
第18週
6/18  期末考週 (繳交期末報告)