課程資訊
課程名稱
生物資訊學實習
Bioinformatic Lab. 
開課學期
99-2 
授課對象
生命科學院  生命科學系  
授課教師
阮雪芬 
課號
LS3006 
課程識別碼
B01 31060 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期四3,4,@(10:20~) 
上課地點
生科419 
備註
初選不開放。F群選擇必修。請先徵求授課教師同意。
限學士班三年級以上 且 限本系所學生(含輔系、雙修生)
總人數上限:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/992bil 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主在介紹現今在生物資訊
領域的相關知識.課程內容包括:
Introduction, Biological
Databases, Analysis at the
Nucleotide and Protein
Level, Inferring
Relationships等,並進行現場操
作,讓學生熟悉生物資訊學軟體
及其應用。
 

課程目標
希望訓練學生利用生物資訊工具 進行其它課程的資料收集及分析 
課程要求
必修或同時修生物資訊學 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
參考書目
Bioinformatics: A practical guide to the analysis of genes
and proteins (2005), Andreas D. Baxevanis and B. F.
Francis Ouellette, Wiley-Liss (藝軒) 
指定閱讀
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期末考 
30% 
 
2. 
平時報告 
30% 
平時報告遲交每次扣學期成績1分,未交則扣學期成績3分。  
3. 
平時表現 
20% 
三次曠課未到,學期成績不及格。 遲到一次扣學期成績一分,依此類推。  
4. 
期中考 
20% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
02/24  分配電腦及分組 
第2週
03/03  Biological Databases I: Mapping Database 
第3週
03/10  Biological Databases II: Sequence Database 
第4週
03/17  Biological Databases III: Information Retrieval from Biological Databases 
第5週
03/24  Analysis at the Nucleotide Level I: Predictive Methods Using DNA Sequences 
第6週
03/31  Analysis at the Nucleotide Level II: Predictive Methods Using RNA Sequences 
第7週
04/07  Analysis at the Nucleotide Level III: Sequence Polymorphism 
第8週
04/14  Analysis at the Protein Level I: Predictive Methods Using Protein Sequences 
第9週
4/21  期中考 
第10週
04/28  Analysis at the Protein Level II: Protein Structure Prediction and Analysis 
第11週
05/05  Analysis at the Protein Level III: Intermolecular Interactions and Biological Pathways 
第12週
05/12  Inferring Relationships I: Assessing Pairwise Sequence Similarity: BLAST and FASTA 
第13週
05/19  Inferring Relationships II: Creation and Analysis of Protein Multiple Sequence Alignment 
第14週
05/26  Inferring Relationships III: Phylogenetic Analysis 
第15週
06/02  Inferring Relationships IV: Using DNA Microarrays to Assay Gene Expression 
第16週
06/09  Inferring Relationships V: Proteomics and Protein Identification 
第17週
06/16  期末考