週次 |
日期 |
單元主題 |
第1週 |
9/23 |
<b>本堂結構生物學概論的學習內容介紹:
1)結構生物學指什麼?
2)結構生物學在生化科技和生物醫學之角色。
3)一個綠茶的故事
4)我們用 UCSF ChimeraX 來看蛋白質。
5)學期末,你要會做蛋白質進行形變的電影。</b> |
第2週 |
9/30 |
<b>1)觀看和分析生命分子結構軟體介紹
2)蛋白筫和其他生命大小分子有什麼特色?
3)我們來看胺基酸在結構組成和功用上的本領(1/2)</b> |
第3週 |
10/07 |
<b>1)我們來看胺基酸在結構組成和功用上的本領(2/2)
2)用軟體來看看,這些組合起來的結構,施展功能的實例。</b> |
第4週 |
10/14 |
<b>蛋白質的二級結構是基礎:五大基本結構。</b> |
第5週 |
10/21 |
<b>1) 蛋白筫的二級結構的化學性質
2) 蛋白笕三級和四級結構:五大構形組合型態。
3) 蛋白質結構分類
4) 以軟體看基本結構</b> |
第6週 |
10/28 |
<b>1)Protein functions within a cell.
2)Functional domains.</b> |
第7週 |
11/04 |
<b>1)結構解析三大方法:
2)X-光, CryoEM 和 NMR 的特色
3)我怎麼選,用那一個方法呢?
4) About X-ray diffraction</b> |
第8週 |
11/11 |
<mark>
期中考
</mark> |
第9週 |
11/18 |
<b>1)X-ray diffraction technology
2) 從基因到做出蛋白質,生物資訊上的處理。</b> |
第10週 |
11/25 |
<b>1) Bring Your Own Computer (BYOC), 實際來用軟體解結構
* MR-practice-List.zip: Contains a .pdb, sequence in fasta file format, and a .sca for lysozyme.
2) Unplugged Bioinformatics in 2nd structure prediction</b> |
第11週 |
12/02 |
<b>【No class】
<b>Prepare your group report</b>
Think about: can you display those binding with ChimeraX?
蛋白質行使功能時的力量:
1)雙硫鍵
2)離子鍵
3)氫鍵
4)疏水結合力
5)凡德瓦力和其它</b> |
第12週 |
12/09 |
<b>第一組:Central Dogma 路徑</b> |
第13週 |
12/16 |
<b>第二組: Central Dogma 路徑
第三組:感光蛋白質</b> |
第14週 |
12/23 |
<b>第一組:Central Dogma 路徑
第五組+第六組:離子通道蛋白質</b> |
第15週 |
12/30 |
<b>第七組+第八組:G-protein coupled receptor - G proteins</b>
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第16週 |
1/06 |
<b>第九組+第十組報告:Two-component System
第四組: 感光蛋白質</b> |
第17週 |
1/13 |
(因首次規劃 16 週課程。或許所有報告向下延後一週或兩週。可討論。) |