課程資訊
課程名稱
基因體與基因體學
Genome and Genomics 
開課學期
100-2 
授課對象
生命科學院  植物科學研究所  
授課教師
林白翎 
課號
PlBio5017 
課程識別碼
B42 U1170 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期五6,7,8(13:20~16:20) 
上課地點
生科3A 
備註
限學士班三年級以上
總人數上限:40人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1002gng 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

基因體定序為生物學開創了一個新紀元。這項前所未有的浩大工程將生物學與高通量自動化科技及資訊學相互整合。遺傳密碼的解讀帶來分子遺傳學及生物學的新知,並指出學術研究與科技應用的新方向。本課程針對這些科技與新知逐一闡述。內容包括:
1. 序論
2. 基因體結構
3. 定序科技
4. 比較基因體學
5. 基因抑制:基因體及個別基因的突變研究
6. 基因表現總覽與高通量功能基因體學研究
7. 蛋白質體學與蛋白質結構體學
8. 遺傳迴路:轉錄調控及蛋白質交互作用網絡
9. 新陳代謝體學及總體生化網絡
10. 微生物及胞器的基因體
11. 真核生物模式系統的基因體
12. 人類基因體
13. 基因體學與疾病研究
14. 基因體學與化學藥物篩選及設計
15. 基因體學與生物醫藥研發
16. 基因與細胞治療
17. 基因體學研究的倫理、法律與社會議題
 

課程目標
明瞭基因體學的內涵、時代意義、及其對科技與文明的影響,找出學生個人志趣與所習課目的關聯,培養由知識衍生的使命感,共創人類光明遠景。 
課程要求
學生須具備基礎生物學及分子生物學的知識,探討學術與科技的承先啟後、跨領域的整合,培養主動求知的習慣,建立前瞻研究的視野與能力。評分方式:筆試 40% (期中考、期末考各20%),報告 40% (基因體學科技、應用各20%),課堂討論 20% 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
參考書目
1. 基因工程及基因體學原理:
Primrose SB, Twyman RM (2012) Principles of Gene Manipulation and Genomics (8th Edition). Wiley-
Blackwell, Oxford UK (forthcoming).

Primrose, SB, Twyman, RM (2006) Principles of Gene Manipulation and Genomics (7th Edition).
Blackwell Publishing http://www.blackwellpublishing.com/primrose/

2. 基因體醫學應用:
Primrose, SB, Twyman, RM (2004) Genomics: Applications in Human Biology,
Blackwell Publishing (繁體中文譯本 2005, 俄文譯本 2008).

 
指定閱讀
1. 基因工程及基因體學原理:
Primrose SB, Twyman RM (2012) Principles of Gene Manipulation and Genomics (8th Edition). Wiley-Blackwell, Oxford UK (forthcoming).

Primrose, SB, Twyman, RM (2006) Principles of Gene Manipulation and Genomics (7th Edition). Blackwell Publishing http://www.blackwellpublishing.com/primrose/

2. 基因體醫學應用:
Primrose, SB, Twyman, RM (2004) Genomics: Applications in Human Biology,
Blackwell Publishing (繁體中文譯本 2005, 俄文譯本 2008).

3. 其他隨堂指定文獻  
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
口頭報告(一) 
20% 
「基因體學科技」文獻專題報告 
2. 
期中考 
20% 
 
3. 
口頭報告(二) 
20% 
「基因體學應用」文獻專題報告 
4. 
期末考 
20% 
 
5. 
課堂討論 
20% 
課堂互動、問答、小考 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/24  Introduction 
第2週
3/02  Genome Organization- Textbook: Principles of Gene Manipulation and Genomics (PGMG) Chapter 16 
第3週
3/09  Sequencing Technology: Strategies, Instrumentation and Bioinformatics- PGMG Chapters 1~7, 9, 17 
第4週
3/16  Comparative Genomics- PGMG Chapter 18 
第5週
3/23  Expression Profiling and Functional Genomics- PGMG Chapters 19, 20 with reference to Chapters 12~15 
第6週
3/30  Proteomics, Protein Structural Genomics, and Metabolomics- PGMG Chapters 21, 22, 24 
第7週
4/06  Review- Textbook: Genomics: Applications in Human Biology (GAHB) Chapter 2 
第8週
4/13  Genetic Circuits and Global Biochemical Networks- PGMG Chapter 23 
第9週
4/20  Overview: structural genomics, metabolomics, global interacting networks 
第10週
4/27  Genomes of Microbes and Organelles; Genomes of Eukaryotic Model Systems  
第11週
5/04  The Human Genome  
第12週
5/11  Genomes of Organisms of Interest and Synthetic Biology  
第13週
5/18  Genomics and Diseases- GAHB Chapters 1, 3~5; PGMG Chapter 25  
第14週
5/25  Genomics and Drug Discovery/Development- GAHB Chapter 7; PGMG Chapters 25, 26  
第15週
6/01  Genomics and Biopharmaceuticals- GAHB Chapters 1, 6; PGMG Chapter 26  
第16週
6/08  Gene and Cell Therapy; The Ethical, Legal, and Social Issues of Genomics Research - GAHB Chapter 8; PGMG Chapter 26 
第17週
6/15  期中考調課 
第18週
6/22  Final Exam