這門課主要在讓學生能實際的操作各種不同的分子演化相關的分析軟體。課程內容設計的對象是針對研究所以及大學部高年級對分子演化、生物資訊、基因體學、譜系分析有興趣的同學。除了基本的序列分析之外，本課程也將針對不同的譜系分析方法，如距離法、最大簡約分析、似然性分析、以及貝葉氏導出式分析，和分子鐘的估算、正向選汰分析等進行實作的練習。