課程資訊
課程名稱
文獻中的研究方法與技術1
Research Methods and Techniques in Literatures (1) 
開課學期
110-1 
授課對象
生命科學院  生化科學研究所  
授課教師
余榮熾 
課號
BChem5028 
課程識別碼
B46 U0850 
班次
 
學分
1.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三3,4(10:20~12:10) 
上課地點
普204 
備註
本課有先修科目規定,請詳課程大綱。
總人數上限:80人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1101BChem5028_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

(因為不喜歡線上教學,前三週不上課。)

本課程主要授課的目標學生為生化與細胞分子生物相關研究所學生,以及已進入相關研究室操作實驗從事研究的大學部學生。
對研究技術的不了解常是閱讀文獻的障礙;許多從事研究的學生也常出現研究設計與組織的缺失。本課程主要的設計,希望能讓研究所學生多廣泛的了解生化與細胞分子生物相關的研究中,常用的技術的原理。
每次課程將以一篇高品質之研究文獻為範本,講解其中使用的技術,以及研究的設計與組織。
每次兩節課,課程排至期中結束。 

課程目標
讓學生多廣泛的了解生化與細胞分子生物相關的研究中,常用的技術與原理,提升學生閱讀了解文獻的能力,同時幫助個人研究時的實驗設計與研究組織。 
課程要求
大學部學生:生物化學(4學分)或分子生物學(2學分) 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
參考書目
待補 
指定閱讀
待補 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/22  不上課,不喜歡線上教學 
第2週
9/29  不上課 
第3週
10/06  不上課 
第4週
10/13  課程介紹
Plasmid expression vector, WB, IHC, IP
(A secreted PTEN phosphatase that enters cells to alter signaling and survival-Science 2013)

課程錄影連結
Youtube: https://youtu.be/nIJ3be10Z5k
iSpring: https://ispri.ng/J0Nn2 
第5週
10/20  DNA-Protein Pulldown, RT-qPCR, dual Reporter assay, EMSA, ChIP-qPCR
(Yin Yang 1 protein ameliorates diabetic nephropathy pathology through transcriptional repression of TGFβ1-Sci Transl med 2019)

課程錄影連結
Youtube: https://youtu.be/Gpkiz8YjlDA
iSpring: https://ispri.ng/lv1WX 
第6週
10/27  Protein purification columns, In vitro transcription/translation, Protein ID by LC-MS/MS, Co-IP
(KPC1-Mediated Ubiquitination and Proteasomal Processing of NF-κB-Cell 2015)

課程錄影連結
Youtube: https://youtu.be/NWgov9em4t0
iSpring: https://ispri.ng/8x6xJ 
第7週
11/03  KO, cKO, iKO, BrdU Incorporation assay, TUNEL assay, Transgenic, Tet-On/Tet-Off
(Meis1 regulates postnatal cardiomyocyte cell cycle arrest-Nature 2013)

課程錄影連結
Youtube: https://youtu.be/1xUMW5qJacQ
iSpring: https://ispri.ng/NGV3X 
第8週
11/10  停課一次(期中考週) 
第9週
11/17  ChIP, Viral expression systems, IRES, PLA
(Transcription factor YY1 is essential for regulation of the Th2 cytokine locus and for Th2 cell differentiation-PNAS 2013)

課程錄影連結
Youtube: https://youtu.be/BpoO32QIUlg
iSpring: https://ispri.ng/GZy9J 
第10週
11/24  Interactome, N6-NeMeRIP-Seq, RIP-qPCR, TET-ON/OFF-iKD
(The SMAD2/3 Interactome-Nature 2018)

課程錄影連結
Youtube: https://youtu.be/T5xkHuchN7M
iSpring: https://ispri.ng/BJZ7v 
第11週
12/01  Gene disruption using CRISPR–Cas9 & Genome-wide CRISPR–Cas9 screen
Tandem mass tags (TMT)-based quantitative proteomics (Isobaric labeling-based quantitative proteomics)
Plasma membrane proteins enrichment through aminooxy-biotinylation

[CMTM6 maintains the expression of PD-L1 and regulates anti-tumour immunity-Nature 2017]

課程錄影連結
Youtube: https://youtu.be/k65LX2Dk8ac
iSpring: https://ispri.ng/0l1MD 
第12週
12/08  期末考 (Open Book)