課程資訊
課程名稱
文獻中的研究方法與技術2
Research Methods and Techniques in Literatures 2 
開課學期
110-2 
授課對象
生命科學院  生化科學研究所  
授課教師
余榮熾 
課號
BChem5030 
課程識別碼
B46 U0870 
班次
 
學分
1.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期四3,4(10:20~12:10) 
上課地點
新204 
備註
總人數上限:80人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1102BChem5030_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

此課程延續上學期之「文獻中的研究方法與技術1」

本學期課程內容,相對於「文獻中的研究方法與技術1」,有較多的 genomics與 proteomics等,系統性的、大規模的研究

課程主要授課的目標學生為生化與細胞分子生物相關研究所學生,以及已進入相關研究室操作實驗從事研究的大學部學生。

對研究技術的不了解常是閱讀文獻的障礙;許多從事研究的學生也常出現研究設計與組織的缺失。本課程主要的設計,希望能讓研究所學生多廣泛的了解生化與細胞分子生物相關的研究中,常用的技術,其技術的原理。

每週的課程,將以一篇高品質之研究文獻為範本,詳細講解其中使用的技術,以及研究的設計與組織。 

課程目標
讓學生多廣泛的了解生化與細胞分子生物相關的研究中,常用的技術與原理,提升學生閱讀了解文獻的能力,同時幫助個人研究時的實驗設計與組織。 
課程要求
大學部學生:生物化學(4學分)或分子生物學(2學分) 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
參考書目
無 
指定閱讀
待補 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/17  本週不上課,下週開始 
第2週
2/24  RNA-seq, GO and IPA analyses, ATAC-seq, Chem-seq, ChIP, dCas9-effector

Epigenetic activation and memory at a TGFB2 enhancer in systemic sclerosis-Sci Transl Med 2019 
第3週
3/03  Chemical Genetic Discovery, pET/BL21(DE3), Click, EMSA, RNA-EMSA

Chemical genetic discovery of PARP targets reveals a role for PARP-1 in transcription elongation-Science 2016 
第4週
3/10  Synthetic biology, Synchronized Lysis Circuit (SLC), Nanobody (SdAb), Phage display

Programmable bacteria induce durable tumor regression and systemic antitumor immunity-Nature Medicine 2019 
第5週
3/17  停課一次 
第6週
3/24  HITS-CLIP (CLIP-Seq), Polysome profiling, Growth (Gene) Phenotype Analysis (CRISPRi screen)

ERα is an RNA-binding protein sustaining tumor cell survival and drug resistance-Cell 2021 
第7週
3/31  CAR T cells, single-chain variable fragment (scFv), P2A self-cleavage peptide, Transposon-mediated gene transfer

Senolytic CAR T cells reverse senescence-associated pathologies-Nature 2020 
第8週
4/07  期中考週,停課一次 
第9週
4/14  PathDetect Signal Transduction Pathway cis-Reporting Systems,
Immunoprecipitation Phosphatase Activity Assay, Quantitative (Phospho)Proteomics [SILAC]

Allosteric Activators of Protein Phosphatase 2A Display Broad Antitumor Activity
Mediated by Dephosphorylation of MYBL2-Cell 2020 
第10週
4/21  CRISPR Genome editing, Antibody phage display

Mechanism of disease and therapeutic rescue of Dok7 congenital myasthenia-Nature 2021

課程錄影連結
Youtube: https://youtu.be/4Mg08uThon0
iSpring: https://ispri.ng/WVB2N 
第11週
4/28  期末考 (Open Book)