課程資訊
課程名稱
蛋白質結構與功能
PROTEIN STRUCTURE AND FUNCTION 
開課學期
98-2 
授課對象
生命科學院  生物工業組  
授課教師
張文章 
課號
Prog5085 
課程識別碼
P05 U3230 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期四7,8(14:20~16:20) 
上課地點
 
備註
本課程中文授課,使用英文教科書。必選10學分課程之ㄧ,研究生請洽授課教師。與徐駿森合開
總人數上限:40人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/982protein2010 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
本課程尚未建立核心能力關連
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

蛋白質科學(Protein Science)在過去數年間的發展極為快速,這要歸功於一些關鍵性的技術突破:在立體構造的研究方法上,如X-光繞射結晶學,以及核磁共振(NMR)光譜學方面的進展,使得研究速度加快;研究材料更廣泛。而在其他領域內,如基因體(Genomics)的分析結果提供了更多蛋白質研究題材,也更豐富了蛋白質科學的內容。
蛋白質的研究在過去曾經有一段比較沈潛的時期,這是因為在分子生物學蓬勃發展的年代,大家都把注意力放在分子生物學上面而對於蛋白質投入較少的心力。時至今日,蛋白質的研究顯得迫切而具有關鍵性,因為許多生物的基因體序列都已完全解開,接下來的課題便要著落在蛋白質的研究上。畢竟蛋白質是生命現象的主要執行者,而基因只是一個藍圖,DNA序列解開之後,它所轉譯出來的蛋白質有何種立體構造、具有那些生物功能、如何由其構造來解釋或推測其功能、等等;這些就是蛋白質研究的主題。
本課程「蛋白質結構與功能」的目標如上所述,藉由教授講解以引導同學們由基礎化學原理而漸進瞭解蛋白質構造要素,蛋白質的安定性,以及蛋白質之間或蛋白質與其他分子的交互作用。有了這些概念就可進而解釋蛋白質的功能:例如酵素的作用機轉;蛋白質與DNA的交互作用(基因調控);血紅素的作用機轉、等等。
 

課程目標
To teach the students
1) how to extract relevant information from the PDB files and to analyze a protein’s structure.
2) how to explain a protein's function from its structural features.
3) to know some model enzymes and regulatory proteins in terms of their structure and function relationship.
4) to know the principles and techniques involved in the determination of protein structures.
5) to get familiar with a few common biophysical techniques in protein sciences.
 
課程要求
 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
每週四 17:20~17:40 
指定閱讀
 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期末考 
50% 
 
2. 
期中考 
50% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/25  Biochemistry of amino acids (I) 
第2週
3/04  Biochemistry of amino acids (II) 
第3週
3/11  Proteomics and mass spectrometry (I) 
第4週
3/18  Introduction to Protein Structure; Graphics software for structural analysis 
第5週
3/25  structural proteomics and high-throughput protein production  
第6週
4/01  Alpha-Domain Structures; Hemoglobin structure and function 
第7週
4/08  Alpha-Domain Structures; Hemoglobin structure and function 
第8週
4/15  Alpha-Domain Structures; Hemoglobin structure and function; Review 
第9週
4/22  Mid-term Exam 
第10週
4/29  Beta-structures and Influenza proteins 
第11週
5/06  Protein folding; chaperones; conformational diseases 
第12週
5/13  Enzymes 
第13週
5/20  Protein Kinases 
第14週
5/27  Protein structure determination (I) : protein crystallography 
第15週
6/03  Protein structure determination (II) : biomolecular NMR technique 
第16週
6/10  Biophysical methods to probe molecular interaction
 
第17週
6/17  Structural bioinformatics : molecular modeling and docking